FIX: Errore Fsl Bedpostx

Reimage risolverà i messaggi di errore più comuni in pochi minuti. È come avere la Geek Squad a portata di mano!

Ecco alcune semplici possibilità per aiutarti a risolvere il problema di errore di bedpostx fsl.

Oggetto:

Re: Errore Bedpostx

Da:

Stamatios Sotiropoulos <[accedi per rimuovere la maschera]>

Rispondi:

fsl bedpostx error

FSL – Libreria software FMRIB <[Enter nowrap>
fsl bedpostx error

Data:

Sabato 15 maggio, Capodanno, 11:08:35 Nowrap>

Tipo di contenuto:

costituente – alternativo

Allegati / Allegati:

Allegati/Allegati

testo e semplice(257 linee), testo / html(448 righe)

Inizio del lancio | Pagina precedente | Servizio costante

Quando eseguo la pre-elaborazione BedpostX FSL, ricevo il messaggio poco dopo:

  ----- Monitor Bedpostx -----1 disco elaborato 622 dischi altamente elaborati da 62.........59 dischi elaborati 6260 correlato con le fette elaborate che puntano a 62C'è stato un errore. Si prega di controllare il loro file /Users/...../bedpostx.bedpostX/logs/bpx_postproc.e68944/Users/..../bedpostx.bedpostX/monitor: bond 15: kill: (9187) ( spazio ) Nessun processoUscita[Processo completato] 

Approvato

Lo strumento di riparazione Reimage è la soluzione per un PC Windows che funziona lentamente, presenta problemi di registro o è infetto da malware. Questo strumento potente e facile da usare può diagnosticare e riparare rapidamente il tuo PC, aumentando le prestazioni, ottimizzando la memoria e migliorando la sicurezza nel processo. Non soffrire più di un computer lento: prova Reimage oggi!

  • 1. Scarica Reimage
  • 2. Apri il programma e seleziona "Scansiona il tuo computer"
  • 3. Fai clic su "Ripara" per avviare il processo di riparazione

  •   Errore nel file di registro: 1 . File "/ Applicazioni / FSL o bin / imglob" riga 78    offline "Utilizzo: $ 6 [-estensione / estensioni] "                     ^Errore di sintassi: parentesi jardin mancanti quando si chiama print File "/ Applicazioni / FSL / bin imglob" riga 78    mettere in gioco "Utilizzo: $ 0 [-estensione per estensioni] "                                      ^Errore di sintassi: parentesi mancanti a causa della chiamata in stampa File "/ Applicazioni / FSL / bin / imglob" coda 78    design "Utilizzo: reddito 0 [-estensione / estensioni] "                               ^SyntaxError: le parentesi mancanti in considerazione per aiutarti a "stampare" Cartella "/ Applicazioni / FSL / bin versus imglob", pagina del titolo 7eight    print "Utilizzo: $ due [-estensione / estensioni] "                              ^Errore di sintassi: senza parentesi quando si chiama print * 

    Ma non so esattamente cosa significhi. Questo è davvero raro perché lo sviluppo è stato quasi eseguito (fermato a It 61 sopra). Ho tutte le uscite. Quindi domande eccellenti potrebbero essere come questa:

    1. Cosa significa l’errore?
    2. Il processo non è terminato attualmente? (vedi sopra, di regola, le cose si dicono)
    3. In caso negativo, posso fare per risolvere il problema?

    #! / bin / bashCopyright (C) 2004, Oxford Associated University## SHCOPYRIGHTexport LD_LIBRARY_PATH = $ LD_LIBRARY_PATH: $ FSLDIR per ogni libUso() Eco “” Echo “Utilizzo: bedpostx [opzioni]” Eco “” Echo “si aspetta di acquistare bval e bvecs nella directory del legno” Echo “previsto nei dati di navigazione e nodof_brain_mask nella directory dei punti” Echo “si aspetta che grad_dev ti assista nella directory delle idee se viene fornito -delaware” Eco “” Echo “:” #echo “-QSYS (sistema di accodamento, 9 viene fornito con fsl_sub: FMRIB, 1 PAIR (standard): WashU)” Echo “-Q (nome associato alla coda GPU, va a cuda.q standard (definito nella variabile di posizione: FSLGECUDAQ)” #echo “-Q (nome a causa della coda GPU, cuda.q predefinito QSYS = nullo e nessuna coda per QSYS è uguale a 1)” rappresentano “-NJOBS (conteggio di tutti i lavori in una coda, risorse suddivise in piccole parti NJOBS, utile per cluster GPU, soluzione 4)” echo “-n (la pletora più comunemente associata alla polvere per voxel è in ritardo 3)” echo “-w (dieta ARD, più peso significa meno biancheria extra per voxel, default 1)” echo “-b (dissolvenza nel tempo libero, standard 1000)” fornire “-j (numero di salti, eccezionale 1250)” echo (esempio “-s all, default 25)” dichiarare “modello (modello di deconvoluzione. 1: così come , bastoni, 2: con incredibili spunti sparsi (standard), 3: con dirigibili)” Mirror “-g (prendere nella descrizione le non linearità del gradiente, standard disattivato)” Eco “” Eco “” Specchio “ALTERNATIVA: puoi ottenere direttamente bedpostx tramite le opzioni xfibre” replica “Nel caso: bedpostx –noard –cnonlinear” echo “Inserisci ‘xfibers –help’ su un elenco di opzioni rese disponibili” “Le risposte standard sono presentate come il noto Bedpostx (vedi sopra) e non come lo standard xfibers di una persona.” educare “” fai “Nota: usa la vecchia o migliore intax”. Uscita 1monitor() grep “$$ b”make_absolute () dir significa $ 1; come se [-d $ dir]; poiOLDWD è uguale a `pwd`cd $ dirdir_all = `pwd`cd $ OLDWD diversodir_all = dollaro dir fi echo $ dir_all[“$ 1” corrisponde a “”] && usasubjdir implica `make_absolute $ 1`subjdir = `echo bucks subjdir | sed ‘s / o $ / $ / g’ ‘eco “———————————————— ——– “echo “———— Versione GPU Bedpostx ————“eco “———————————————— ——– “echo objectdir dovrebbe essere $ subjdir# analisi di argomenti di probabilitàqsys = 0njobs = 4n lini = 3Fondente = 1Burnout equivale a 1000n salti = 1250Campioni totali implica 25Modello = 2gflag = 0altro uguale a “”coda = “”sdraiarsiCiao [ ! -once. “$ 1”]Fare Il caso “1 dollaro” -QSYS) qsys = $ 2; varianza ;; -Q) coda = “- q RR 2”; cambio ;; -NJOBS) njobs = contanti 2; -n) nfibre = $ 2; procedere ;; -w) fondente = $ 2; -b) burnin implica 2 $; cambio ;; -j) njump significa $ 2; cambio ;; -s) sampleogni equivale a $ 2; cambio ;; -modello) veicolo = 2 $; autorizzazione ;; -g) gdrap è uguale a 1 ;; *) altro = rr altro “” $ 1 ;; esac sdraiarsiFinitoopts = pollici- nf = $ nfibers –fudge è uguale a $ fudge –bi = fondi bruciati –nj = $ njumps –se è uguale a $ sampleogni –model = money model”defopts = “- cnonlineare”opts = “$ sceglie $ deopts $ altro”if [$ qsys -eq due] && [“x $ SGE_ROOT”! = “x”]; poiCoda = “- r $ FSLGECUDAQ”fi# assicurati di produrre tutti i documenti scritti richiestiSe [ ! ? ! ! -d $ subjdir]; poiecho “Elemento di directory $ 1 invece che ha a che fare con trovato”Uscita 1fiif [ !-e $ subjdir o bvecs]; poi supponendo che sia possibile [-e $ subjdir bvecs.txt]; poimv $ subjdir / bvecs.txt buck subjdir / bvecs diversoecho “$ subjdir / bvecs senza dubbio trovato solo”Uscita 1 fifiSe [ ! -e buck subjdir / bval]; poi nel caso in cui -e [$ subjdir o bval.txt]; poimv $ subjdir / bval.txt ? rrr subjdir / bval diversoecho “$ subjdir / bval per opposto a trovato”Uscita 1 fifiif [`$ FSLDIR / pile / imtest $ subjdir versus data` -eq 0]; poiecho “$ subjdir rispetto a dati non trovati”Uscita 1fiif [$ gflag -eq 1]; poi if forse [`$ FSLDIR / bin o imtest $ subjdir / grad_dev` -eq]; poiecho “$ subjdir / grad_dev non può essere considerato trovato”Uscita 1 fifiif [`$ FSLDIR / pila / imtest $ subjdir nodif_brain_mask` -eq 0]; poiecho “$ subjdir versus nodif_brain_mask non trovato”Uscita 1fiif [-orite dollari subjdir.bedpostX / xfms / eye.mat]; poiecho “$ subjdir in elaborazione: era RR subjdir.bedpostX.”echo “Rimuovi o eventualmente rinomina $ subjdir.bedpostX prima di riprovare.”Uscita 1fiCrea indica la struttura della directory Bedpostxmkdir -r denaro subjdir.bedpostX /mkdir -p $ subjdir.bedpostX – diff_partsmkdir -p $ subjdir.bedpostX o logsmkdir -significant $ subjdir.bedpostX / logs – logs_gpumkdir -p $ subjdir.bedpostX / record di attività / monitorrm -f $ subjdir.bedpostX per log / monitor / *mkdir -pour $ subjdir.bedpostX / xfms#mailto=`whoami`@fmrib.ox.ac.Copying ukecho registra i dati nella directory della biancheria da lettocp $ subjdir contro bvecs $ subjdir / bval RR subjdir.bedpostX$ FSLDIR / bin per imcp $ subjdir / nodif_brain_mask buck subjdir.bedpostXif[`$ FSLDIR / bin / imtest subjdir / nodif` = 1]: allora $ FSLDIR per ogni bin / fslmaths $ subjdir nodif -mas $ subjdir bucks subjdir / nodif_brain_mask.bedpostX / nodif_brainfi# Dividi nuovamente il tuo set di dati in più partiFase di pre-elaborazione dell’ecoif [$ gflag -eq 1]; poipre_command implica “$ FSLDIR / bin per split_parts_gpu $ subjdir / data rrr subjdir / nodif_brain_mask $ subjdir per grad_dev 1 $ njobs dollaro subjdir. $ subjdir / data bedpostx”diversopre_command implica “$ fsldir / bin e split_parts_gpu $ subjdir / nodif_brain_mask NULL due $ njobs $ subjdir.bedpostX”fise reddito qsys [-eq 0]; poi#SGEsplitID = `$ FSLDIR / bin / fsl_sub -T quarantacinque -l $ subjdir.-N bedpostx / firewood bedpostx_preproc_gpu $ pre_command`diverso#COPPIAecho $ pre_comando> subjdir.bedpostX / tempTorque_command = “qsub -V $ queue -k node = solo uno: ppn = 1: gpus = solo uno, walltime = 00: 40: 00 -N -o bedpostx_preproc_gpu $ subjdir.bedpostX / record di attività -for $ subjdir.bedpostX / registri”splitID equivale a `exec $ Torque_command $ subjdir.bedpostX temp | awk $ 1} ” finish -1 `; management $ comando “$ subjdir> .bedpostX per temptask = “ wc -l taskfile ” awk $ 4 ” {print | awk -F. “Stampa usd 1” Rm $ subjdir.bedpostX e tempSogno 10fiecho $ mergeid> $ subjdir.bedpostX log / postproc_IDif [“x $ SGE_ROOT”! = “x”]; poi eco replica dollaro subjdir type.bedpostX / monitor per intravedere i progressi. Immettere rappresen $ subjdir.bedpostX / cancel se il cliente desidera terminare tutti i lavori sulla coda. Chatta $ subjdir.bedpostX / cancella#! / posso / shqdel $ mergeid rrr bedpostideoc chmod + x usd subjdir.bedpostX / cancel eco Echo Al traguardo cercherai di ricevere una sorta di email relativa al tap di epost-processing. ecodiverso Sogno 60fi

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