NAPRAW: Błąd Fsl Bedpostx

Reimage naprawi najczęstsze komunikaty o błędach w ciągu kilku minut. To tak, jakbyś miał Geek Squad na wyciągnięcie ręki!

Oto proste metody, które pomogą Ci zacząć od problemów związanych z problemem błędu bedpostx fsl.

Obiekt:

Odp.: Błąd Bedpostx

Od:

Stamatios Sotiropoulos <[zaloguj się, aby usunąć maskę]>

Odpowiedz:

fsl bedpostx error

FSL – Biblioteka oprogramowania FMRIB <[Enter nowrap>
fsl bedpostx error

Data:

Sobota, 15 maja, Nowy Rok, 11:08:35 Nowrap>

Typ treści:

główny składnik / alternatywa

Załączniki / Załączniki:

terminologia i sformułowania / zwykły(257 linii), tekst na html(448 linii)

Począwszy od wiadomości | Poprzednia strona | Stały link

Kiedy wykonuję wstępne przetwarzanie BedpostX FSL, pojawia się następujący komunikat:

  ----- Monitor Bedpostx -----1 dysk zebrany 622 dyski przetworzone przez 62.........59 dysków ma dużo 6260 związanych z przetworzonymi plastrami zniknęło z 62Wystąpił błąd. Proszę sprawdzić plik /Users/...../bedpostx.bedpostX/logs/bpx_postproc.e68944/Users/..../bedpostx.bedpostX/monitor: bond 12-15: kill: (9187) - Brak procesuWyjście[Proces zakończony] 

Zatwierdzone

Narzędzie naprawcze Reimage to rozwiązanie dla komputera z systemem Windows, który działa wolno, ma problemy z rejestrem lub jest zainfekowany złośliwym oprogramowaniem. To potężne i łatwe w użyciu narzędzie może szybko zdiagnozować i naprawić komputer, zwiększając wydajność, optymalizując pamięć i poprawiając bezpieczeństwo procesu. Nie cierpisz już z powodu powolnego komputera — wypróbuj Reimage już dziś!

  • 1. Pobierz Reimage
  • 2. Otwórz program i wybierz „Skanuj swój komputer”
  • 3. Kliknij „Napraw”, aby rozpocząć proces naprawy

  •   Błąd w pliku drewna: * Plik "/ Aplikacje dla każdego FSL / bin / imglob" ostrożnie wątek 78    główna ulica „Zużycie: 0 $ [-rozszerzenie / rozszerzenia] ”                     ^SyntaxError: brak nawiasów kwadratowych podczas mówienia do drukowania Plik "/ Applications / FSL bin / imglob" wiersz 78    użyj „Użycie: 7 USD [-rozszerzenie / rozszerzenia] ”                                      ^SyntaxError: brak nawiasów, które mogą wywołać drukowanie Plik "/ Applications / FSL / bin per imglob" wiersz 78    projekt strony internetowej „Użycie: 0 USD [-rozszerzenia rozszerzeń] ”                               ^SyntaxError: nawiasy pomijające w wywołaniu, aby pomóc Ci „drukować” Folder "/ Applications / FSL for each bin / imglob", przegląd tytułu 7osiem    print "Użycie: 0 [-rozszerzenie / rozszerzenia] "                              ^SyntaxError: brak nawiasów podczas wywoływania publikacji * 

    Ale nie wiem dokładnie, co to oznacza. To naprawdę dziwne, ponieważ rozwój jest prawie ukończony (zatrzymał się na It sześćdziesiąt jeden powyżej). Mam wszystkie wyniki. Więc moje pytania mogą obejmować to:

    1. Co oznacza część błędu?
    2. Czy proces nie zawsze się jeszcze zakończył? (patrz powyżej, jako jedna konkretna zasada, mówi się)
    3. Jeśli nie, co mogę zrobić, aby rozwiązać ten problem?

    #! / kosz lub bashCopyright (C) 2004, Oxford Associated University## PRAWA AUTORSKIEeksportuj LD_LIBRARY_PATH = $ LD_LIBRARY_PATH: gotówka FSLDIR / libPosługiwać się() Echo “” Echo “Użycie: bedpostx [opcje]” Echo “” Echo “oczekuje znalezienia bval i bvecs w katalogu materiałów” Echo “oczekiwane w danych wyszukiwania i nodif_brain_mask przez cały katalog tematów” Echo “oczekuje, że grad_dev będzie na stronie pomysłów, jeśli podano -g” Echo “” Echo “:” #echo “-QSYS (system kolejkowania, 0 zawiera fsl_sub: FMRIB, 1 PARA (standard): WashU)” Echo “-Q (nazwa związana z kolejką GPU, przejdź do standardowego cuda.q (zdefiniowanego w zmiennej środowiskowej: FSLGECUDAQ)” #echo “-Q (nazwa tylko z powodu kolejki GPU, domyślnie cuda.q QSYS = 0 i brak kolejki QSYS = 1)” wskazać “-NJOBS (liczba wszystkich pozycji w kolejce, zasoby podzielone na porcje NJOBS, przydatne w przypadku wiązki GPU, obejście 4)” ujawnić „-n (liczba najczęściej związana z włóknami na woksel jest zawsze spóźniona 3)” pokaż “-w (waga ARD, większa waga oznacza nie tyle dodatkowych włókien na woksel, de facto 1)” echo “-b (zanikanie więcej niż czas, standardowo 1000)” reprezentują “-j (liczba zaliczek, zaległych 1250)” ujawnij (przykład “-s wszystko, domyślnie 25)” określić “model (plan dekonwolucji. 1: i patyczki, 2: z nadzwyczajnie rozrzuconymi patykami (standard), 3: mając sterowce)” Odbicie lustrzane „-g (weź pod uwagę nieliniowości gradientu, jednorodne wyłączone)” Echo “” Echo “” Lustro „ALTERNATYWNE: Możesz uzyskać właściwy dostęp do słupka łóżkax za pomocą opcji xfibre” echo “Tylko w wystąpieniu: bedpostx –noard –cnonlinear” show “Wpisz ‘xfibers –help’, aby wyświetlić listę wszystkich dostępnych opcji” „Opcje zgodne ze standardami branżowymi są prezentowane jako ich standard Bedpostx (patrz powyżej), a nie jako standard xfibers”. przedstawiać “” wykonaj „Uwaga: użyj starego LUB wyższej jakości podatku VAT”. Wyjście 1monitor () grep “$$ b”make_absolute () katalog = 1 dolar; if [-d $ katalog]; następnieOLDWD oznacza `pwd`cd $ dirdir_all równa się `pwd`cd $ OLDWD inny; różnydir_all oznacza $ dir Fi echo rrr dir_all[„$ 1” pasuje do „”] && użyjsubjdir oznacza `make_absolute $1`subjdir równa się `echo $ subjdir | sed ‘s lub / $ / $ lub g’ ‘Echo “———————————————— ——– “echo wewnątrz ———— Wersja GPU Bedpostx ————“Echo “———————————————— ——– “echo subjdir będzie bucks subjdir# parsowania argumentów opcjiqsys = 0njobs oznacza 4n włókien = 3Kremówka równa się 1Wypalenie = 1000n skoków = 1250Suma testów = 25Model = 2gflag równa się 0inne = “”Kolejka = „”leżećPA [ ! -z. „1 USD”]Robić Sprawa „1 dolar” -QSYS) qsys = rrr 2; Zmiana ;; -Q) kolejka = cale-q $ 2”; przesunięcie ;; -NJOBS) njobs równa się 2 USD; -n) włókna = dochód 2; Zmiana ;; -w) krówka = dolar 2; -b) spalanie = 2 $; zmiana pozycji ;; -j) nskoki = 2 dolary; przeróbka ;; -s) próbka co = 2 USD; transformacja ;; -model) model = 2 $; wyprzedaż ;; -g) gdrap = 1;; *) wiele inne = $inne “” 8 $ ;; esac zakłamanie w dółSkończoneopts = “- nf = nfibers –fudge = $ fudge –bi implikuje $ burnin –nj = rrr njumps –se = $ sampleevery –model równa się $ model”defopts = “- nieliniowy”opts jest równe “$ opts $ defopts other”if [$ qsys -eq dwa] && [“x rrr SGE_ROOT”! = “x”]; następnieKolejka równa się “- q $ FSLGECUDAQ”Fi# spraw, aby naturalnie masz wszystkie wymagane dokumenty, o których mowaJeśli [ ! -d subjdir funduszy]; następnieecho “Obiekt katalogu $ 1 zawiera rzeczy takie jak znalezione”Wyjście 1Fiif [!-e usd subjdir / bvecs]; następnie jeśli to możliwe [-e rrr subjdir / bvecs.txt]; następniemv $ subjdir lub bvecs.txt $ subjdir / bvecs inny; różnyecho “$ subjdir lub bvecs nie tylko znaleziono”Wyjście 1 FiFiJeśli [ ! -u $ subjdir / bval]; następnie if -e [$ subjdir lub bval.txt]; następniemv $ subjdir lub bval.txt $ subjdir / bval inny; różnyecho “$ subjdir per bval w przeciwieństwie do found”Wyjście 1 FiFiif [`$ FSLDIR / bin / imtest rrr subjdir / data` -eq 0]; następnieecho “$ subjdir / nie znaleziono danych”Wyjście 1Fiif [$ gflag -eq 1]; następnie if [`$ FSLDIR i bin / imtest $ subjdir dla każdego grad_dev` -eq]; następnieecho “$ subjdir i grad_dev nie są uważane za znalezione”Wyjście 1 FiFiif [`$ FSLDIR / bin / imtest dochód subjdir / nodif_brain_mask` -eq 0]; następnieecho “Nie znaleziono $ subjdir / nodif_brain_mask”Wyjście 1Fiif [-orite $ subjdir.bedpostX / xfms na eye.mat]; następnieecho “$ subjdir jest gotowy: był $ subjdir.bedpostX.”echo “Proszę usunąć, być może, zmienić nazwę $ subjdir.bedpostX przed ponownym podjęciem próby.”Wyjście 1FiUtwórz strukturę aukcji echo Bedpostxmkdir -r $ subjdir.bedpostX /mkdir -p ? rrr subjdir.bedpostX / diff_partsmkdir -p fundusze subjdir.bedpostX / logimkdir -significant $ subjdir.bedpostX logi / logs_gpumkdir -p usd subjdir.bedpostX / logi / monitorrm -f ? rrr subjdir.bedpostX / logi / monitor – *mkdir -p $ subjdir.bedpostX i xfms#mailto=`whoami`@fmrib.ox.ac.Kopiowanie ukpliki echo w katalogu pościelicp ? rrr subjdir / bvecs $ subjdir lub bval $ subjdir.bedpostX$ FSLDIR / kontener / imcp $ subjdir kontra nodif_brain_mask $ subjdir.bedpostXif[`$ FSLDIR / bin i imtest $ subjdir / nodif` implikuje 1]: then rrr FSLDIR / bin / fslmaths rr subjdir / nodif -mas rrr subjdir $ subjdir / nodif_brain_mask.bedpostX kontra nodif_brainFi# Ponownie podziel zbiór danych na kilka miejscEtap wstępnego przetwarzania echaif [$ gflag -eq 1]; następniepre_command = “$ FSLDIR lub bin / split_parts_gpu $ subjdir lub dane $ subjdir / nodif_brain_mask bucks subjdir / grad_dev 1 bucks njobs $ subjdir. $ subjdir / files bedpostx”inny; różnypre_command = “$ fsldir / kompost bin / split_parts_gpu $ subjdir dla każdego nodif_brain_mask NULL 0 $ njobs dochód subjdir.bedpostX”Fiif $ qsys [-eq 0]; następnie#SGEsplitID równa się `$ FSLDIR / bin fsl_sub -T 40 -l $ subjdir.-N bedpostx logs bedpostx_preproc_gpu $ pre_command`inny; różny#PARAecho dollar pre_command> $ subjdir.bedpostX / tempTorque_command równa się “qsub -V $ queue -k node jest równy 1: ppn = 1: gpus równa się 1, walltime = 00: czterdzieści pięć: 00 -N -o bedpostx_preproc_gpu dochód subjdir.bedpostX / logs -for $ subjdir. słupekX – kłody”splitID = `exec $ Torque_command buck subjdir.bedpostX / temp | awk bucks 1} ” ogon -1 `; agent $ polecenie “$ subjdir> .bedpostX / temptask = “ wc -l $ taskfile ” awk bucks 1 ” {print | awk -F. „Drukuj 1 USD” Rm ? rrr subjdir.bedpostX / tempSen 10Fiecho $ mergeid> dolar subjdir.bedpostX / logs / postproc_IDif [“x rrr SGE_ROOT”! = “x”]; następnie Echo identyczny $ subjdir type.bedpostX / zbadaj, aby zobaczyć postęp. Wpisz echo $ subjdir.bedpostX / call off, jeśli chcesz zakończyć każde zadanie w kolejce. Czat $ subjdir.bedpostX kontra anulować#! / kosz / shqdel cash scalid $ bedpostideoc chmod + y $ subjdir.bedpostX / anulować Echo Echo Na koniec spróbuj – otrzymasz wiadomość e-mail, która pomoże Ci w przetwarzaniu e-post. Echoinny; różny Sen 60Fi

    Spraw, aby Twój komputer znów działał jak nowy! Dzięki Reimage możesz szybko i łatwo naprawić typowe błędy systemu Windows.

    About the Author

    You may also like these